风声过去了，就找来了牟斌，问他李梦阳在牢里怎么样了，孝宗表扬了牟斌几句，就说李梦阳也休息够了，还是把他放出来吧。李梦阳从“诏狱”里出来以后，依然跟张氏家族顶着干，张松龄一看，这哥们儿不仅没有受一点儿伤害，而且进一趟“诏狱”似乎还发胖了，立刻去找张皇后，说这次咱们得来点儿狠的，把他置于死地、永不得翻身。

张皇后又被家里人教唆一番，跑到孝宗那里哭哭啼啼起来，这次孝宗可不耐烦了，他生气地说：“你们这些人，分明是想让我把李梦阳致死嘛，可是我怎么能够就为了你们几个人，而把帮助我治理国家的人除掉呢？”这话说得再明确不过了，相比较我朱家的江山，你们那点儿小利益根本不算回事。张皇后一听皇上生气了，吓得赶紧退了出去，回去让娘家人都收敛点儿，别看咱们是皇上的亲戚，要是皇上发怒了咱们也免不了脑袋搬家。牟斌不畏惧张氏家族的权势，公正治狱，在狱中照顾如李梦阳这样的罪犯，得到了朝臣们的赞扬。

牟斌在正德时期，担任锦衣卫掌镇抚司事指挥佥事，改成南镇抚司管事，又因为善待刘瑾下令抓到锦衣卫狱的人犯，惹恼了刘瑾。刘瑾矫上命说他徇私坏法，打廷杖三十，并降为百户闲住，后来刘瑾伏诛，给事中王珝等人推荐牟斌，便又官复原职。牟斌仍于镇抚司掌印理刑，因为淮安知府刘祥案件，牟斌又降职为百户，调到沔阳卫带俸，后实录中再无记载。